自第一代神武天皇起直至第三十三代推古天皇，這33位天皇在日本《古事記》中出現過。但自神武至第十四代仲哀，這14位天皇在歷史中無法確認，應該是《古事記》及《日本書紀》為了完成從神代到人代的過渡而虛構出來的人物，而在仲哀天皇與應神天皇中間填充長達70年歷史的神功皇后，也不能說是實際的存在。因此，有著比較真實的存在依據的第十五代應神天皇，應該是號稱「萬世一系」的日本天皇的真正祖先吧。
此外，第一個應用「天皇」這一稱號的，應該是在推古朝攝政的聖德太子吧。他在遣小野妹子給隋煬帝的國書中寫道「東天皇敬白西皇帝」，曾引起過隋煬帝的怒火。之前都以的日本統治者「王」或「大王」作為稱呼。我國《宋書·蠻夷傳》里所記載的「倭五王時代」中的「倭贊、珍、濟、興、武五王」，即是指自仁德天皇起至雄略天皇止，除履中天皇外的五位日本統治者。
序號
在位時間（西曆）
謚 號
年 號
1 前660 – 前585 神武天皇
2 前581 – 前549 綏靖天皇
3 前549 – 前511 安寧天皇
4 前510 – 前477 懿德天皇
5 前475 – 前393 孝昭天皇
6 前392 – 前291 孝安天皇
7 前290 – 前215 孝靈天皇
8 前214 – 前158 孝元天皇
9 前158 – 前98 開化天皇
10 前97 – 前30 崇神天皇
11 前29 – 70 垂仁天皇
12 71 – 130 景行天皇
13 131 – 190 成務天皇
14 192 – 200 仲哀天皇
15 270 – 310 應神天皇
16 313 – 399 仁德天皇
17 400 – 405 履中天皇
18 406 – 410 反正天皇
19 412 – 453 允恭天皇
20 453 – 456 安康天皇
21 456 – 479 雄略天皇
22 480 – 484 清寧天皇
23 485 – 487 顯宗天皇
24 488 – 498 仁賢天皇
25 498 – 506 武烈天皇
26 507 – 531 繼體天皇
27 531 – 535 安閑天皇
28 535 – 539 宣化天皇
29 539 – 571 欽明天皇
30 572 – 585 敏達天皇
31 585 – 587 用明天皇
32 587 – 592 崇峻天皇
33 592 – 628 推古天皇（女）
註：推古二年（593年）至推古三十年（622年）由聖德太子攝政。
日本紀元年表（二）
孝德天皇統治的大化年間，以中大兄皇子（即後來的天智天皇）、中臣鐮足等人為首的改革派發動了日本歷史上從奴隸制到封建制過渡的大化革新。並經過天武、持統跟文武三代，將大化革新未盡的事業加以完成。之後，日本進入了封建社會，日本天皇制也進入了在歷史上為期不長的一段鼎盛時期。這一鼎盛時期貫穿了奈良時代，一直到平安時代中期。
奈良時代（710-794年），可以說是女帝稱雄的時代。這一時期，先後經歷了元明、元正、聖武、孝謙、淳仁、稱德、光仁、桓武八代天皇，其中元明、元正跟孝謙（重登基後改稱稱德）三位均為女皇，在位統治近30年。此外，聖武天皇在位的25年，完全由光明皇后在幕後操縱。而淳仁天皇在位的六年，則由已宣布退位的孝謙女皇掌握實權。因此，這一時代真正由男性掌握權力的只有14年，為光仁天皇跟桓武天皇。
延曆十三年（794年），桓武天皇將都城由平城京（即奈良）遷往平安京（即京都），平安時代開始。遷都的那一夜，火樹銀花，一派祥和的景象，似乎預示著新都平安京能夠「萬年平安」。
可是，自70年後的平安時代中期開始，皇室頹廢，實權外落到藤原氏手中。號稱「萬世一系」的天皇家族從此走上了衰敗的道路，被旁人所操縱。自藤原氏政權起，經歷平氏政權、鎌倉幕府、室町幕府、豐臣政權、江戶幕府，天皇無權這一凄慘的狀況一直持續了一千年左右。直到十九世紀江戶幕府滅亡，政權才被奉還於天皇。
序號 在位時間 （西曆）
謚 號
年 號
34 629 – 641 舒明天皇
35 642 – 645 皇極天皇（女）
36 645 – 654 孝德天皇 大化、白雉
37 655 – 661 齊明天皇（女）
38 661 – 671 天智天皇
39 671 – 672 弘文天皇
40 673 – 686 天武天皇 朱鳥
41 686 – 697 持統天皇（女）
42 697 – 707 文武天皇 大寶、慶雲
43 707 – 715 元明天皇（女） 和銅
44 715 – 724 元正天皇（女） 靈龜、養老
45 724 – 749 聖武天皇 神龜、天平
46 749 – 758 孝謙天皇（女） 天平感寶、天平勝寶、天平寶字
47 758 – 764 淳仁天皇
48 764 – 770 稱德天皇（女） 天平神護、神護慶雲
49 770 – 781 光仁天皇 寶龜、天應
50 781 – 806 桓武天皇 延曆
51 806 – 809 平城天皇 大同
52 809 – 823 嵯峨天皇 弘仁
53 823 – 833 淳和天皇 天長
54 833 – 850 仁明天皇 承和、嘉祥
55 850 – 858 文德天皇 仁壽、齊衡、天安
56 858 – 876 清和天皇 貞觀
57 876 – 884 陽成天皇 元慶
58 884 – 887 光孝天皇 仁和
59 887 – 897 宇多天皇 寬平
60 897 – 930 醍醐天皇 昌泰、延喜、延長
61 930 – 946 朱雀天皇 承平、天慶
62 946 – 967 村上天皇 天曆、天德、應和、康保
63 967 – 969 冷泉天皇 安和
64 969 – 984 圓融天皇 天祿、天延、貞元、天元、永觀
65 984 – 986 花山天皇 寬和
66 986 – 1011 一條天皇 永延、永祚、正歷、長德、長保、寬弘
註： 第37代齊明女皇為第35代皇極女皇重新登基後的稱號，因此她們是同一人；同樣，第46代孝謙與第48代稱德也是同一人。
其之三
在藤原氏掌握大權之後，天皇始終無法將權力真正掌握在自己手裡。除了藤原氏、平氏跟豐臣氏三個時期是關白攝政外，其餘時期的權力都是掌握在幕府將軍手裡。但不管是實際上也好，還是名義上也好，畢竟因為是日本的最高統治者的緣故，在皇權旁落後的歷代天皇中，也有那麼一些既不甘心做外戚或幕府政權的傀儡，並且也有一定實力的天皇，為將大權奪還而努力。後醍醐天皇即是其中最有代表性的人物。
繼後嵯峨天皇之後，他的兩個兒子即後深草天皇跟龜山天皇相繼即位，從那時開始，天皇開始分為兩個皇統——即後深草一系的持明院統跟龜山一系的大覺寺統。這兩派圍繞皇位繼承問題展開了激烈的爭鬥。面對這種情況，對皇位繼承擁有決定權的鎌倉幕府採取不偏不倚的政策，制定了兩統交替即位的「兩統迭立」方案。按照這一方案，1318年，大覺寺統的後醍醐天皇即位。
後醍醐天皇即位後，立即重用勤王派的大臣，與鎌倉幕府展開鬥爭。各地勤王軍紛紛舉起討幕大旗。後來，由投靠後醍醐天皇的幕府武將足利尊氏給予鎌倉幕府致命一擊。1333年5月，鎌倉幕府滅亡。後醍醐天皇將政權握在自己手中，並取我國漢光武帝劉秀消滅王莽、復興漢室之意，改年號為「建武」，這就是日本歷史上的「建武中興」。
然而，由於建武新政權對廣大武士階層採取防範政策，引起各地武士的不滿和失望。1335年7月，足利尊氏奏請天皇封他為征夷大將軍，未獲，憤然離京。次年5月，足利軍在湊川大敗朝廷的新田義貞軍和楠木正成軍，攻入京都。8月，足利尊氏擁持明院統豐仁親王為光明天皇。12月，後醍醐天皇逃入吉野山，並在此再次即位，稱為「南朝」，並稱京都方面的北朝為「偽朝」。日本進入長達50多年的南北朝時代。
在南北朝時代，雖然北朝的持明院統居住在京都，然而，象徵天皇神權的「三神器」——八咫鏡、坂瓊曲玉和草薙劍卻在南朝大覺寺統手裡。因此，雖然幕府擁立北朝，但是北朝卻並不能算是「正統」。
1392年，在將軍足利義滿（就是《聰明的一休》裡面的那個將軍，^^）的調停下，南朝的後龜山天皇將「三神器」交予北朝的後小松天皇，自己進入京都大覺寺當了上皇。然而，足利義滿並沒有兌現自己的諾言，即並沒有實行「兩統迭立」的方案。雖然大覺寺統後龜山天皇的後代們發現上了當，但是為時已晚。於是從後小松天皇開始，歷代的天皇均為持明院統的嫡系後代，而大覺寺統的皇族們再也無緣染指皇位。
序號
在位時間（西曆）
謚 號
年 號
67 1011 – 1016 三條天皇 長和
68 1016 – 1036 後一條天皇 寬仁、治安、萬壽、長元
69 1036 – 1045 後朱雀天皇 長曆、長久、寬德
70 1045 – 1068 後冷泉天皇 永承、天喜、康平、治歷
71 1068 – 1072 後三條天皇 延久
72 1072 – 1086 白河天皇 承保、承歷、永保、應德
73 1086 – 1107 堀河天皇 寬治、嘉保、永長、承德、康和、長治、嘉承
74 1107 – 1123 鳥羽天皇 天仁、天永、永久、元永、保安
75 1123 – 1141 崇德天皇 天治、大治、天承、長承、保延、永治
76 1141 – 1155 近衛天皇 康治、天養、久安、仁平、久壽
77 1155 – 1158 後白河天皇 保元
78 1158 – 1165 二條天皇 賓士、永曆、應保、長寬
79 1165 – 1168 六條天皇 永萬、仁安
80 1168 – 1180 高倉天皇 嘉應、承安、安元、治承
81 1180 – 1185 安德天皇 養和、壽永
82 1185 – 1198 後鳥羽天皇 文治、建久
83 1198 – 1210 土御門天皇 正治、建仁、元久、建永、承元
84 1210 – 1221 順德天皇 建歷、建保、承久
85 1221 仲恭天皇
86 1221 – 1232 後堀河天皇 貞應、元仁、嘉祿、安貞、寬喜、貞永
87 1232 – 1242 四條天皇 天福、文歷、嘉禎、歷仁、延應、仁治
88 1242 – 1246 後嵯峨天皇 寬元
89 1246 – 1259 後深草天皇 寶治、延長、康元、正嘉、正元
90 1259 – 1274 龜山天皇 文應、弘長、文永
91 1274 – 1287 後宇多天皇 建治、弘安
92 1287 – 1298 伏見天皇 正應、永仁
93 1298 – 1301 後伏見天皇 正安
94 1301 – 1308 後二條天皇 乾元、嘉元、德治
95 1308 – 1318 花園天皇 延慶、應長、正和、文保
96 1318 – 1339 後醍醐天皇 元應、元亨、正中、嘉歷、元德、元弘、建武、延元
97 1339 – 1368 後村上天皇 興國、正平
98 1368 – 1383 長慶天皇 建德、文中、天授、弘和
99 1383 – 1392 後龜山天皇 元中
1331 – 1333 （北朝）光嚴天皇 正慶
1336 – 1348 （北朝）光明天皇 歷應、康永、貞和
1348 – 1351 （北朝）崇光天皇 觀應
1352 – 1371 （北朝）後光嚴天皇 文和、延文、康安、貞治、應安
1371 – 1382 （北朝）後圓融天皇 永和、康歷、永德
1382 – 1392 （北朝）後小松天皇 至德、嘉慶、康應、明德
100 1392 – 1412 後小松天皇 應永
註：從第96代後醍醐天皇到第99代後龜山天皇，這四代天皇是南朝天皇，居住在吉野山。但由於北朝沒有象徵神權的「三神器」，因此這四代天皇仍是「正統」，所以按南朝來記代。直到後龜山天皇將「三神器」交予北朝後小松天皇，後小松天皇才能算是第100代天皇。
其之四
雖然自藤原氏以來，天皇皇權便已旁落到攝政關白或是幕府將軍手中，但使天皇的政治地位跌落至谷底的，是日本歷史上最後一個幕府——江戶時代德川幕府。
1615年，幕府公布《禁中並公家諸法度》十七條，詳細地限制了天皇和公卿貴族的權力和行動。《法度》明確地規定，天皇「以學問為第一」，無須過問國事。凡宮廷官員的任命、天皇公卿的服飾冠帶、天皇的出巡等等均需徵得幕府的同意。《法度》中唯一保留天皇權力的條文只有第八條：天皇有權按「本朝先規」決定年號。於是，無論是形式上還是實際上，皇室的權力完全被幕府所剝奪。
1853年，隨著培理艦隊的到來，日本鎖了兩百年的國門被堅船利炮敲開。日本歷史的年輪轉到了被稱為「幕末」的時期。隨著倒幕派的烽起，孝明天皇的去世，德川幕府統治走到了盡頭。1868年1月，末代將軍德川慶喜交出政權，孝明天皇之子睦仁繼承皇位，改年號為「明治」，同時發布「王政復古」詔書。從此，天皇重新回到了政治舞台的中心。
1868年11月，明治天皇將都城由京都遷往江戶，同時將江戶改名為東京。遷都東京後，明治政府大張旗鼓地開始了資產階級改革，這就是日本歷史上重要的「明治維新」。明治維新以後的日本，不再是任由列強欺辱的封建小國，而是本身成為了帝國主義列強之一。對沙皇俄國的宣戰以及取得日俄戰爭的最後勝利，使日本的野心急速膨脹，最終走上了軍國主義道路。
1926年，大正天皇沒，皇太子裕仁登基，改年號「昭和」。昭和時代初期，日本軍國主義的侵略擴張大規模展開。1931年（昭和6年）秋，「九·一八」事變爆發，日軍侵佔我國東北。1937年（昭和12年）7月7日，日軍挑起「蘆溝橋事變」，發動全面侵華戰爭，抗日戰爭爆發。同年12月13日，侵華日軍佔領南京，發動長達6周、慘絕人寰的「南京大屠殺」，約30多萬中國軍民慘死在侵略者的屠刀之下。1941年（昭和16年），日軍偷襲珍珠港，太平洋戰爭爆發。這一系列戰爭，給中國、朝鮮、東南亞及太平洋地區的人民帶來地獄般的災難，同時，日本人民也承受著戰爭所帶來的苦難。而昭和天皇裕仁，對於這一系列戰爭的發動有著不可推卸的責任。1945年（昭和20年）8月15日，日軍投降。美軍佔領日本，改日本專制天皇製為君主立憲制，天皇作為日本的象徵被保留下來。
1989年1月7日清晨，昭和天皇去世，前半段伴隨著戰爭的陰影，後半段構建了日本繁榮的基礎的昭和時代降下帷幕。同日，皇太子明仁繼位，改年號「平成」。
序號
在位時間（西曆）
謚 號
年 號
101 1412 – 1428 稱光天皇 正長
102 1428 – 1464 後花園天皇 永享、嘉吉、文安、寶德、享德、康正、長祿、寬正
103 1464 – 1500 后土御門天皇 文正、應仁、文明、長享、延德、明應
104 1500 – 1526 後柏原天皇 文龜、永正、大永
105 1526 – 1557 後奈良天皇 享祿、天文、弘治
106 1557 – 1586 正親町天皇 永祿、元龜、天正
107 1586 – 1611 後陽成天皇 文祿、慶長
108 1611 – 1629 後水尾天皇 元和、寬永
109 1629 – 1643 明正天皇（女）
110 1643 – 1654 後光明天皇 正保、慶安、承應
111 1654 – 1663 後西天皇 明歷、萬治、寬文
112 1663 – 1687 靈元天皇 延寶、天和、貞享
113 1687 – 1709 東山天皇 元祿、寶永
114 1709 – 1735 中御門天皇 正德、享保
115 1735 – 1747 櫻町天皇 元文、寬保、延享
116 1747 – 1762 桃園天皇 寬延、寶曆
117 1762 – 1770 後櫻町天皇 明和
118 1770 – 1779 後桃園天皇（女） 安永
119 1779 – 1817 光格天皇 天明、寬政、享和、文化
120 1817 – 1846 仁孝天皇 文政、天保、弘化
121 1846 – 1866 孝明天皇 嘉永、安政、萬延、文久、元治、慶應
122 1867 – 1912 明治天皇 明治
123 1912 – 1926 大正天皇 大正
124 1926 – 1989 昭和天皇 昭和
125 1989 – （明仁） 平成